Bộ Y tế khẳng định, giá viện phí mới vẫn được tính theo nguyên tắc thu một phần viện phí (chỉ gồm 3 yếu tố: chi phí thuốc, máu, dịch truyền; chi phí điện nước, thông tin liên lạc, xử lý rác thải; chi phí duy tu, bảo dưỡng thiết bị y tế). Các chi phí còn lại như lương cán bộ y tế, khấu hao nhà cửa… vẫn do ngân sách Nhà nước chi trả.
Theo cơ quan BHXH Việt Nam, với giá viện phí mới, các bệnh viện không được thu thêm bất kỳ khoản nào của người bệnh bởi các yếu tố cấu thành viện phí (không do ngân sách chi trả) đã được cơ quan BHYT thanh toán đủ.